Die Züge des Meridian in Richtung Salzburg fahren auch heute (DI) nur zwischen München-Rosenheim-Freilassing. Da die Bundespolizei in den Zügen, die aus Österreich kommen, Passkontrollen durchführt, haben die Züge in Freilassing bis zu eine Stunde Verspätung. Um den Fahrplan weiter zuverlässig aufrecht erhalten zu können, fahren die Züge nur bis Freilassing, so die Begründung.

Sollten die Passkontrollen nach Salzburg verlegt werden, werden die Züge auch wieder dorthin fahren. Reisende, die von Freilassing nach Salzburg oder in die Gegenrichtung fahren möchten, können die S-Bahn oder die Fernverkehrszüge Railjet und EuroCity nutzen. Diese Züge fahren allerdings nur im Zweistundentakt und mit beschränkter Kapazität.